Institut de l'intelligence artificielle de l'Alberta

DrugBank : Découverte de médicaments guidée par l'IA

Publié

11 mai 2021

Application de l'IA

Traitement du langage naturel (NLP)

Industrie

Biotechnologie

Les 5 P

Production

Amii aide une start-up d'Edmonton à valider des projets et à accroître ses capacités techniques internesVue d'ensemble

DrugBank est l'une des entreprises de technologie de la santé à la croissance la plus rapide au Canada. Au cours de l'année écoulée, elle a connu une croissance exponentielle et s'est concentrée sur la création de produits alimentés par sa base de données de connaissances pharmaceutiques curées et structurées. DrugBank fournit des solutions de données aux entreprises de soins de santé qui travaillent dans la médecine de précision, la découverte de médicaments, la réaffectation de médicaments et les applications logicielles cliniques. Sa ressource publique, DrugBank Online, a été citée dans plus de 12 000 publications universitaires et est utilisée par des millions de chercheurs et de professionnels de la santé dans le monde entier.

En plus de servir les professionnels de la santé, DrugBank offre des produits tels que des données cliniques et scientifiques structurées à certaines des organisations les plus prestigieuses et des sociétés pharmaceutiques de marque dans le monde, telles que Healx, Aria Pharmaceuticals, et Molecular Health. Depuis sa création en 2006, DrugBank s'est beaucoup développée, en commençant par un projet de recherche à l'Université d'Alberta, en entrant dans la phase de commercialisation en 2015, et est maintenant la plus grande base de données de connaissances pharmaceutiques au monde.

"L'avenir de la médecine et de la découverte de médicaments est axé sur les données", déclare Craig Knox, directeur de la technologie. "DrugBank est dans une position unique ; la technologie de base consiste en une base de données riche et hautement structurée, et ce qui est unique, c'est qu'elle offre à la fois des informations cliniques et scientifiques. Les informations cliniques sont des choses comme les effets secondaires et les interactions médicamenteuses. Les informations scientifiques concernent la façon dont les médicaments agissent dans le corps."

DrugBank a commencé son engagement avec Amii en 2018, lorsqu'elle a reçu sa première évaluation de faisabilité de l'IA. "Nous avons commencé à utiliser le traitement du langage naturel (NLP) presque immédiatement lorsque nous l'avons construit", explique le directeur général Michael Wilson. "Cela a toujours fait partie de DrugBank et nous ne cessons d'y mettre de plus en plus l'accent."

Avec l'aide d'Amii, DrugBank a embauché son premier spécialiste en PNL en 2019, qui a fait avancer son projet d'apprentissage machine (ML), offrant une grande victoire pour ses données internes et une expertise PNL croissante au sein de l'entreprise.

Approche

Avant de s'engager avec Amii, DrugBank était à la Explorer le site du spectre d'adoption de l'IA d'Amii. À la fin de leur engagement, DrugBank est entrée dans la phase d'adoption de l'IA. Mise en œuvre de étape."Nous n'avons jamais voulu nous positionner comme une entreprise strictement spécialisée dans l'IA lorsque nous avons démarré en tant que projet commercial", déclare Knox, "mais c'est un développement continu et c'est très important pour la façon dont nous utiliserons cette technologie à l'avenir."

Grâce à son engagement avec Amii, DrugBank a :

  1. Projets validés. Afin de réduire les risques et d'assurer la pérennité de ses investissements dans un domaine en pleine expansion, DrugBank a travaillé avec Amii pour l'aider à valider ses projets existants et futurs lors de l'élaboration de ses outils.

  2. Embauche d'un spécialiste de la PNL. Amii et DrugBank ont collaboré à la rédaction de l'offre d'emploi, à la sélection des candidats et aux entretiens techniques avec les candidats. Cette collaboration a permis à DrugBank de développer ses connaissances et ses capacités internes en matière de recrutement.

  3. Intégré à la communauté de l'IA. Ayant l'opportunité d'entrer en contact avec des personnes ayant des intérêts similaires dans l'IA et la ML - à la fois dans le monde académique et commercial - DrugBank a participé à une variété de conférences et de rencontres pour aider à sensibiliser, soutenir et développer la communauté de l'IA, et leur activité au sein de celle-ci.

Résultats

"Notre technologie de base, la base de connaissances, qui comprend l'IA pour le contrôle de la qualité du traitement des données, est intégrée dans de nombreux aspects de l'entreprise", explique M. Wilson. "Il ne s'agit pas d'un joli petit paquet que quelqu'un peut nous fournir et que nous pouvons brancher. Le niveau de valeur que nous pouvons obtenir en l'intégrant au cœur de notre entreprise est bien plus élevé."

Dans le monde clinique et scientifique, une base de données sur les médicaments doit répondre à deux critères essentiels : la précision et la couverture. En ce qui concerne la précision des données, l'objectif de DrugBank est de s'approcher le plus possible d'une précision de 100 %, mais la couverture est une tâche difficile car de nombreux articles universitaires sont publiés chaque jour.

"Il est difficile de suivre cette évolution manuellement, à moins que des dizaines de milliers de conservateurs n'essaient de se tenir au courant de ces informations. Nous utilisons donc l'IA en interne pour commencer à extraire une grande partie de ces informations afin d'améliorer notre couverture", explique M. Knox. "En utilisant des outils NLP, les modèles peuvent extraire ces informations et les transmettre à l'équipe de conservation afin qu'elle puisse effectuer le dernier kilomètre. Nous pouvons alors dire : nous pouvons être sûrs que la précision et la couverture de cet ensemble de données particulier sont proches de 100 %.

Conclusion

Grâce à son engagement avec Amii, DrugBank a amplifié l'engagement de l'entreprise en faveur de l'IA et de la ML, ce qui lui a permis de développer son équipe technique et d'accroître sa capacité à communiquer efficacement sur ses concepts et ses projets de ML.

Depuis 2018, DrugBank a quadruplé son équipe et a clôturé un important cycle de financement. Dans les années à venir, Michael Wilson et Craig Knox prévoient d'accroître la capacité technique au sein de DrugBank, tout en investissant dans des talents en IA/ML pour leur entreprise.

"Je pense qu'Amii a contribué à renforcer la réputation de l'Alberta et d'Edmonton dans le domaine de l'IA, ce qui a eu pour effet d'améliorer la façon dont les gens perçoivent notre entreprise", déclare M. Knox. "Nous avons eu des exemples dans le passé où les gens connaissaient Amii ou les chercheurs affiliés, et lorsque l'on sait que nous avons des liens directs avec eux, cela nous aide à gagner en validité sur le plan commercial.

Pour en savoir plus sur les offres de produits de DrugBank, veuillez consulter le site drugbank.com.

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Auteurs

Zvonimir Rac

Stephanie Enders

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